Нестерец Алина Михайловна, аспирант Научно-исследовательского института терапии и профилактической медицины – филиала федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, Российская Федерация; младший научный сотрудник сектора изучения моногенных форм распространенных заболеваний человека федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук»
ул. Бориса Богаткова, 175/1, Новосибирск, 630089,
просп. Академика Лаврентьева, 10, Новосибирск, 630090
Nesterets Alina M., Postgraduate Student of the Research Institute of Therapy and Preventive Medicine – Branch of the Federal State Budgetary Scientific Institution "Federal Research Center Institute of Cytology and Genetics of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences", Novosibirsk, Russian Federation; Junior Researcher of the Sector for the Study of Monogenic Forms of Common Human Diseases of the Federal State Budgetary Scientific Institution "Federal Research Center Institute of Cytology and Genetics of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences"
175/1, B. Bogatkova Str., Novosibirsk, 630089;
10, Lavrentyeva Ave., Novosibirsk, 630090
Кузнецов Александр Александрович, доктор медицинских наук, ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярно-генетических исследований терапевтических заболеваний
ул. Бориса Богаткова, 175/1, Новосибирск, 630089
Kuznetsov Alexander A., MD, Leading Researcher at the Laboratory of Molecular Genetic Studies of Therapeutic Diseases
175/1, B. Bogatkova Str., Novosibirsk, 630089
Иванова Анастасия Андреевна, кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник лаборатории молекулярно-генетических исследований терапевтических заболеваний
ул. Бориса Богаткова, 175/1, Новосибирск, 630089
Ivanova Anastasia A., Candidate of Medical Sciences, Senior Researcher at the Laboratory of Molecular Genetic Studies of Therapeutic Diseases
175/1, B. Bogatkova Str., Novosibirsk, 630089
Гуражева Анна Александровна, младший научный сотрудник лаборатории молекулярно-генетических исследований терапевтических заболеваний
ул. Бориса Богаткова, 175/1, Новосибирск, 630089
Gurazheva Anna A., Junior Researcher at the Laboratory of Molecular Genetic Studies of Therapeutic Diseases
175/1, B. Bogatkova Str., Novosibirsk, 630089
Малютина Софья Константиновна, доктор медицинских наук, профессор, заведующая лабораторией этиопатогенеза и клиники внутренних болезней
ул. Бориса Богаткова, 175/1, Новосибирск, 630089
Malyutina Sofya K., MD, Professor, Head of the Laboratory of Etiopathogenesis and Clinic of Internal Diseases
175/1, B. Bogatkova Str., Novosibirsk, 630089
Денисова Диана Вахтанговна, доктор медицинских наук, главный научный сотрудник лаборатории профилактической медицины
ул. Бориса Богаткова, 175/1, Новосибирск, 630089
Denisova Diana V., MD, Chief Researcher of the Laboratory of Preventive Medicine
175/1, B. Bogatkova Str., Novosibirsk, 630089
Максимов Владимир Николаевич, доктор медицинских наук, профессор заведующий лабораторией молекулярно-генетических исследований терапевтических заболеваний Научно-исследовательского института терапии и профилактической медицины – филиала федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, Российская Федерация; главный научный сотрудник межинститутского сектора молекулярной эпидемиологии и эволюции человека с возложением обязанностей заведующего лабораторией молекулярной генетики человека федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук»
ул. Бориса Богаткова, 175/1, Новосибирск, 630089;
просп. Академика Лаврентьева, 10, Новосибирск, 630090
Maximov Vladimir N., MD, Professor, Head of the Laboratory of Molecular Genetic Studies of Therapeutic Diseases of the Research Institute of Therapy and Preventive Medicine – Branch of the Federal State Budgetary Scientific Institution "Federal Research Center Institute of Cytology and Genetics of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences", Novosibirsk, Russian Federation; Chief Researcher of the Interinstitutional Sector of Molecular Epidemiology and Human Evolution with the assignment of duties of the Head of the Laboratory of Human Molecular Genetics of the Federal State Budgetary Scientific Institution "Federal Research Center Institute of Cytology and Genetics of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences"
175/1, B. Bogatkova Str., Novosibirsk, 630089;
10, Lavrentyeva Ave., Novosibirsk, 630090
Основные положения. У мужчин сибирской популяции обнаружена ассоциация однонуклеотидных полиморфных вариантов rs12143842 и rs4657139 гена NOS1AP с продолжительностью интервала QT.
Цель. Изучить ассоциацию однонуклеотидных полиморфных вариантов rs12143842 и rs4657139 гена NOS1AP с длительностью интервала QT.
Материалы и методы. Исследуемая выборка мужчин (1 353 человека) в возрасте 25–69 лет сформирована из банка ДНК участников международного проекта HAPIEE и скрининга молодых людей 25–44 года, жителей Новосибирска. Из каждой возрастной подгруппы (25–29, 30–34, …, 65–69 лет) отобраны около 10–15% мужчин с коротким, средним и длинным интервалом QT и сформированы соответствующие группы. Генотипирование rs4657139 проведено с помощью полимеразной цепной реакции с последующим анализом полиморфизма длин рестрикционных фрагментов. Генотипирование rs12143842 – с использованием полимеразной цепной реакции в режиме реального времени.
Результаты. В возрасте старше 50 лет генотип СС rs12143842 выявлен у 66,1% мужчин в группе короткого и среднего интервала QT и у 50,6% в группе длинного интервала QТ, в то время как генотип ТТ преобладал в группе с длинным интервалом QT, 10,8% случаев (отношение шансов (ОШ) 3,345, 95% доверительный интервал (ДИ) 1,149–9,739, p = 0,02). Гомозиготный генотип ТТ rs4657139 чаще встречался в группе длинного интервала QT, в 20,1% случаев, в то время как в группах короткого, среднего QT преобладали генотипы AA и AT (p = 0,041). Аналогичная тенденция сохранялась при разделении по возрасту у лиц старше 50 лет (p = 0,031) и в результате сравнения частот генотипов в группах длинного и среднего интервала QT в модели ТT vs АА + АТ и длинный vs короткий + средний QT (p = 0,003).
Заключение. Однонуклеотидные варианты rs12143842 и rs4657139 гена NOS1AP ассоциированы с длительностью интервала QT у мужчин, проживающих в Новосибирске.
Highlights. The association of single nucleotide polymorphic variants rs12143842 and rs4657139 of the NOS1AP gene with the duration of the QT interval was found in men of the Siberian population.
Aim. To study the association of single nucleotide variants rs12143842 and rs4657139 of the NOS1AP gene with the duration of the QT interval.
Methods. The study sample of men (1353 people) aged 25–69 years was formed from the DNA bank of participants in the international HAPIEE project and screening of young people 25–44 years old, residents of Novosibirsk. From each age subgroup (25–29, 30–34, …, 65–69 years old), about 10–15% of men with the shortest, average and longest QT interval were selected and the corresponding groups were formed. Genotyping of rs4657139 was carried out using PCR with RFLP (polymerase chain reaction followed by restriction fragment length polymorphism analysis). Genotyping rs12143842 – using RT-PCR (real-time polymerase chain reaction).
Results. At the age of over 50 years, the CC genotype rs12143842 was detected in 66.1% of men in the group with a short and average QT interval and in 50.6% in the group with a long QT interval, while the TT genotype prevailed in the group with a long QT interval, 10, 8% of cases (odds ratio (OR) = 3.345, 95% confidence interval (CI) 1.149–9.739, p = 0.02). The homozygous TT genotype rs4657139 was more common in the long QT group, in 20.1% of cases, while the AA and AT genotypes predominated in the short, average QT groups (p = 0.041). A similar trend persists when separating by age in people over 50 years of age (p = 0.031) and when comparing genotype frequencies in the long and average QT groups in the model TT vs AA + AT & long QT vs short + average QT (p = 0.003).
Conclusion. Single nucleotide variants rs12143842 and rs4657139 of the NOS1AP gene are associated with the duration of the QT interval in male residents of Novosibirsk.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.