младший научный сотрудник лаборатории молекулярно-генетических исследований терапевтических заболеваний Научно-исследовательского института терапии и профилактической медицины – филиала Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, Российская Федерация; младший научный сотрудник сектора изучения моногенных форм распространенных заболеваний человека федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, Российская Федерация
Junior Researcher at the Laboratory of Molecular Genetic Investigations of Therapeutic Diseases, Institute of Internal and Preventive Medicine – a branch of a Federal Publicly Funded Institution “Institute of Cytology and Genetics of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences”, Novosibirsk, Russian Federation; Junior Researcher at the Laboratory of the Study of Monogenic Forms of Common Human Diseases, Institute of Cytology and Genetics, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences, Novosibirsk, Russian Federation
кандидат медицинских наук ведущий научный сотрудник Научно-исследовательского института терапии и профилактической медицины – филиала Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, Российская Федерация; заведующая сектором изучения моногенных форм распространенных заболеваний человека федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, Российская Федерация
PhD, MD, Leading Researcher at the Institute of Internal and Preventive Medicine – a branch of a Federal Publicly Funded Institution “Institute of Cytology and Genetics of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences”, Novosibirsk, Russian Federation; Head of the Laboratory of the Study of Monogenic Forms of Common Human Diseases, Institute of Cytology and Genetics, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences, Novosibirsk, Russian Federation
научный сотрудник лаборатории молекулярно-генетических исследований терапевтических заболеваний Научно-исследовательского института терапии и профилактической медицины – филиала Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, Российская Федерация; младший научный сотрудник лаборатории молекулярной генетики человека федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, Российская Федерация
Researcher at the Laboratory of Molecular Genetic Investigations of Therapeutic Diseases, Institute of Internal and Preventive Medicine – a branch of a Federal Publicly Funded Institution “Institute of Cytology and Genetics of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences”, Novosibirsk, Russian Federation; Junior Researcher at the Laboratory of Human Molecular Genetics, Institute of Cytology and Genetics, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences, Novosibirsk, Russian Federation
кандидат биологических наук ведущий научный сотрудник сектора геномных механизмов онтогенеза федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, Российская Федерация
PhD, Leading Researcher, Head of the Laboratory of Genomic Mechanisms of Ontogenesis, Institute of Cytology and Genetics, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences, Novosibirsk, Russian Federation
доктор биологических наук старший научный сотрудник лаборатории клинических, биохимических и гормональных исследований терапевтических заболеваний Научно-исследовательского института терапии и профилактической медицины – филиала Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, Российская Федерация
PhD, Senior Researcher at the Laboratory of Clinical, Biochemical and Hormonal Studies of Therapeutic Diseases, Institute of Internal and Preventive Medicine – a branch of a Federal Publicly Funded Institution «Institute of Cytology and Genetics of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences», Novosibirsk, Russian Federation
доктор биологических наук старший научный сотрудник, заведующая лабораторией клинических, биохимических и гормональных исследований терапевтических заболеваний Научно-исследовательского института терапии и профилактической медицины – филиала Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, Российская Федерация
PhD, Senior Researcher, Head of the Laboratory of Clinical, Biochemical and Hormonal Studies of Therapeutic Diseases, Institute of Internal and Preventive Medicine – a branch of a Federal Publicly Funded Institution “Institute of Cytology and Genetics of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences”, Novosibirsk, Russian Federation
член-корреспондент РАН, доктор медицинских наук, профессор, заслуженный деятель науки Российской Федерации генеральный директор федерального государственного бюджетного учреждения «Национальный медицинский исследовательский центр имени академика Е.Н. Мешалкина» Министерства здравоохранения Российской Федерации, Новосибирск, Российская Федерация
MD, Professor, Corresponding Member of the Russian Academy of Sciences, Honored Scientist of the Russian Federation, Head of the Federal State Budgetary Institution “National Medical Research Center named after academician E.N. Meshalkin” of the Ministry of Health of the Russian Federation, Novosibirsk, Russian Federation
научный сотрудник лаборатории патоморфологии федерального государственного бюджетного учреждения «Национальный медицинский исследовательский центр имени академика Е.Н. Мешалкина» Министерства здравоохранения Российской Федерации, Новосибирск, Российская Федерация
Researcher at the Laboratory of Pathomorphology, Federal State Budgetary Institution “National Medical Research Center named after academician E.N. Meshalkin” of the Ministry of Health of the Russian Federation, Novosibirsk, Russian Federation
доктор медицинских наук, профессор заведующий лабораторией патоморфологии федерального государственного бюджетного учреждения «Национальный медицинский исследовательский центр имени академика Е.Н. Мешалкина» Министерства здравоохранения Российской Федерации, Новосибирск, Российская Федерация
MD, Professor, Head of the Laboratory of Pathomorphology, Federal State Budgetary Institution “National Medical Research Center named after academician E.N. Meshalkin” of the Ministry of Health of the Russian Federation, Novosibirsk, Russian Federation
член-корреспондент РАН, доктор медицинских наук, профессор главный научный сотрудник, руководитель Научно-исследовательского института терапии и профилактической медицины – филиал Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, Российская Федерация
MD, Professor, Corresponding Member of the Russian Academy of Sciences, Head of the Institute of Internal and Preventive Medicine – a branch of a Federal Publicly Funded Institution “Institute of Cytology and Genetics of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences”, Novosibirsk, Russian Federation
Основные положения
Исследование показало различия в экспрессии ряда генов в атеросклеротических бляшках разных типов у пациентов с коронарным атеросклерозом. Полученные данные могут стать основой для разработки тест-систем с целью определения динамики атеросклеротического процесса и максимально раннего выявления признаков дестабилизации атеросклеротической бляшки.
Цель. Изучение дифференциальной экспрессии генов, кодирующих биомолекулы, ассоциированные с этиопатогенезом атеросклероза, методом полногеномного секвенирования РНК в стабильной атеросклеротической бляшке фиброзного типа и нестабильной атеросклеротической бляшке дистрофически-некротического типа.
Материалы и методы. Исследование выполнено на образцах атеросклеротических бляшек пациентов с атеросклерозом коронарных артерий без острого коронарного синдрома со стабильной стенокардией напряжения II–IV функционального класса в возрасте 45–65 лет. Забор тканей атеросклеротических бляшек проведен интраоперационно при наличии показаний. Полногеномное секвенирование РНК выполнено с использованием Illumina’s TruSeq RNA Sample Preparation Kit (Illumina, США).
Результаты. Повышение уровня экспрессии генов в стабильных атеросклеротических бляшках отмечено для A2M, ADAMTS13, CSF3, CX3CL1, CXCL1, FGF2, GDF15, ICAM1, IL1A, IL1B, IL6, IL10, PDGFA, PTX3. Наблюдалось восьмикратное статистически значимое увеличение уровня экспрессии генов CFD, CXCL16, FABP4, FLT3, IFNG, IL7, IL15, SELL, TGFA, THBD, TNNT1, VCAM1 и VEGFA (p < 0,001) в нестабильных атеросклеротических бляшках дистрофически-некротического типа.
Заключение. Исследование показало различия в экспрессии ряда генов в атеросклеротических бляшках разных типов у пациентов с атеросклерозом коронарных артерий. Полученные данные могут стать основой для разработки тест-систем с целью определения динамики атеросклеротического процесса и максимально раннего выявления признаков дестабилизации атеросклеротической бляшки.
Highlights
The study showed differences in the expression of a number of genes in atherosclerotic plaques of different types in patients with coronary atherosclerosis. The obtained data can become the basis for the development of test systems in order to determine the dynamics of the atherosclerotic process and detect signs of destabilization of the atherosclerotic plaque as early as possible.
Aim. To study the differential expression of genes encoding molecules associated with the etiopathogenesis of atherosclerosis by the method of genome-wide RNA sequencing in stable atherosclerotic plaque of fibrous type and unstable atherosclerotic plaque of dystopic-necrotic type.
Methods. The study was performed on samples of atherosclerotic plaques of patients with coronary atherosclerosis without acute coronary syndrome with stable angina pectoris of functional class II–IV (FC) at the age of 45-65 years. Tissue sampling of atherosclerotic plaques was performed intraoperatively in the presence of indications. Genome-wide RNA sequencing was performed using Illumina’s TruSeq RNA Sample Preparation Kit (Illumina, USA).
Results. An increase in the level of gene expression in stable atherosclerotic plaques was noted for A2M, ADAMTS13, CSF3, CX3CL1, CXCL1, FGF2, GDF15, ICAM1, IL1A, IL1B, IL6, IL10, PDGFA, PTX3. There was an eightfold statistically significant increase in the level of CFD, CXCL16, FABP4, FLT3, IFNG, IL7, IL15, SELL, TGFA, THBD, TNNT1, VCAM1 and VEGFA gene expression (p<0,001) in unstable atherosclerotic plaques of dystrophic-necrotic type.
Conclusion. The study showed differences in the expression of a number of genes in atherosclerotic plaques of different types in patients with coronary atherosclerosis. The obtained data can become the basis for the development of test systems in order to determine the dynamics of the atherosclerotic process and detect signs of destabilization of the atherosclerotic plaque as early as possible.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.